根据以上职责，市扶贫开发办公室设2个内设机构。

（一）综合科

协助领导处理机关日常工作、文件材料，组织开展调查研究，管理机关行政事务，办理有关机构编制和组织人事工作，负责政务公开工作。

（二）项目管理科（社会扶贫科）

制订扶贫开发规划、计划；负责扶贫开发项目管理，指导各县（市）建立项目库；协调有关部门，承担项目的立项、组织评估认证、申报并检查、验收；管理扶贫资金的下达、监督检查和审计；负责扶贫开发统计监测和信息网络工作；统计贫困人口，统计和汇总贫困县经济开发投资来源、总量、结构，进行效益分析；建立和管理贫困地区基本数据、资料、档案。

负责组织社会各界、各行业参与扶贫开发工作；联系中央国家机关和省直单位定点扶贫工作；安排市级党政领导扶贫点，确定和调整市直党政群机关、企事业单位联系扶贫点；指导帮扶单位开展帮扶活动，总结交流帮扶工作经验。