（一）办公室

负责文电、会议、机要、档案等机关日常工作；承担信息、安全、保密、信访、政务公开等工作;承担机关、直属单位财务、国有资产管理等工作。

（二）环境影响评价科

承担规划环境影响评价、政策环境影响评价以及全市建设项目环境影响评价文件的审批工作，监督管理环境影响评价机构资质。

（三）法规科技宣教科

承办市政府环保目标责任书考核相关事宜；承担机关行政复议、行政应诉等工作；拟订并组织实施环境保护宣传教育纲要；组织开展生态文明建设和环境友好型社会建设的宣传教育工作；承担局新闻审核和发布；承担环境保护科技工作；参与指导和推动循环经济、清洁生产与环保产业发展；组织开展环境监测；调查评估全市环境质量状况并进行预测预警；承担全市环境监测网、信息网建设和管理的有关工作。

（四）污染防治科

组织实施水体、大气、土壤、噪声、光、恶臭、危险固体废物、废弃危险化学品、机动车的污染防治工作；组织拟订有关污染防治规划并对实施情况进行监督；监督管理危险固体废物及废弃危险化学品的安全处置。

（五）农村环境监督管理科

综合协调、统一监督管理农村环境保护工作；组织指导农村环境综合整治工作；指导全市农村生态示范创建和生态农业建设；组织编制全市生态保护规划；对国家级、省级自然保护区的环境保护工作进行监督；组织开展生物多样性保护工作。

（六）污染物排放总量控制科

拟订主要污染物排放总量控制和排污许可证制度并组织实施；提出总量控制计划；考核总量减排情况；承担环境统计和污染源普查工作。