北京交通大学附属中学建校于1957年，前身是北京铁道学院附属中学。曾是海淀区仅有的两所重点中学之一。

1997年更名为北方交通大学附属中学。

2004年被评为北京市示范性高中校。

2017年正式更名为北京交通大学附属中学。

在多年的办学实践中，为党和国家培养了大批的优秀合格人才，他们成为各行各业的精英和领袖，现任外交部长王毅为学校68届校友。

学校连续两次被海淀区教委授予“全面育人，办有特色校”的锦旗，授予“教育现代化改革试点校”的称号，获北京市颁发的“北京市电化教育优类校”并在连续三次荣获“海淀区文明建设先进单位”的基础上，被评为“首都文明单位”。

学校全体师生正在为实现学校三年发展规划提出的：“把该校建设成为北京市一流的现代化示范性高中校”而继续奋进！

交大附中作为一所示范高中校，肩负着历史使命和光荣的责任。我们将一如既往地坚持育人为本和教育改革，坚定信心，扎实工作，为更多普通百姓的子弟创建优质的学校教育，为中华民族的振兴，塑造和培养优秀的人才，真正办人民满意的教育！

北京交通大学附属中学位于著名历史遗迹大钟寺南侧，中关村高科技园区核心地带，毗邻交通干线北三环路，交通十分便利。学校周边坐落着清华大学、中国人民大学、中央财经大学、北京交通大学、北京师范大学等著名高校，双安商场、1733商业空间等大型购物中心，北医三院、海淀医院、人民医院等现代化医疗中心，生活非常方便。

校址设在中国北京海淀区皂君庙12号。

2025年3月10日，北京交通大学附属中学雏鹰议事厅揭牌成立。