镇江市红十字会创建于1911年11月，系辛亥革命时期，为救护战伤病员，由地方热心社会公益事业人士发起，联合各教会医院组成。是中国国内大、中城市最早建立的红十字分会之一，是以从事战地救护、赈灾医疗为主要任务的社会福利性团体，为中国红十字会的地方分支机构。

1913年后曾逐渐消失。

1923年因沪宁线发生战争，镇江商团陆小波等人，鉴于时局灾祸相侵，重新成立了镇江市红十字分会，选胡建春为会长，陆小波为副会长，设议事员12名。

1924年9月，因战伤救护日益繁重，分会下增设医士会，公举基督医院孟享利（美籍）为正主任，叶拱式（英籍），刘稚陵为副主任，并在基督医院、妇幼医院及徐静仁医院内分设医治伤兵医院二所。分会理事中亦增设总务、医务、救护、交际、会计、文牍、庶务等七科。

1925年2月，因伤兵众多，特专设红十字医院于布业公所，又以冬赈局、公善堂为第二医院，利用弘仁医院新屋设第三医院，聘请刘稚陵博士为院长，会务活动一直延续到抗日战争初期。

1948年4月，在军界人士贾韫山、陈海波的倡导下，重新成立镇江红市十字会，贾韫山任会长，陈海波任副会长，当时拥有会员近万人，团体会员4000人，青年会员1000余人，普通会员3000余人。同年9月，又正式开办红十字诊疗所，先由张其华任诊所主任，后聘请意大利人白耀华主持诊所工作。解放前夕，会长、副会长相继离镇，会务活动基本停止。

1950年12月，市政府整顿改组了镇江市红十字会，以陈邦贤为召集人，由市民政科、卫生科会同各有关部门，具体进行会务整顿工作。

1951年6月，经中国红十字总会审批正式成立新的镇江市红十字会组织，定名为中国红十字会镇江市红十字分会，由理事21人组成第一届事事会，并协商产生会长一名，副会长三名，常务理事五名，会长为杨公崖，副会长为陆小波、倪锦忠、陈邦贤。

1952年7月，根据中央政务院指示，各地红十字会改由各级政府卫生部门直接指导，民政部门协助发展会务。红十字会的经费来源也由解放前的自筹改为政府辅助。

1957年3月，市红十字会领导机构进行了调整，会长彭东（市人委），副会长杜毓泉（市卫生局）、张志清（专区医院）、杨公崖（市政协）、赵醒吾（市人委）、刘一萍（团市委）、韩钟泉（市政协）、李志成（市卫生局）。原红十字诊疗所仍继续保留，直至1958年，为支持农村医疗卫生事业，市政府决定撤销镇江市红十字诊疗所，将其设备器材及部分人员充实到宝埝人民公社医院。

1966年“文化大革命”开始后，红十字会的一切会务活动随着组织瘫痪而完全停止。

1978年，党的十一届三中全会以来，镇江市及各县（市）区红十字会、各基层红十字会组织相继恢复。

2005年10月市红十字会理顺体制，独立建制。