（一）成都住房公积金管理中心设16个内设机构：行政管理部、政策管理部、归集业务管理部、贷款业务管理部、运营核算部、财务部、风险管控部（内部审计部）、电子业务管理部、信息技术部、客户服务管理部、法律事务部、人力资源管理部、党群工作部、个贷审批中心、教育培训中心、服务保障中心。

（二）成都住房公积金管理中心设7个业务经办管理机构：第一、第二、第三、第四、第五、第六、第七分中心。

（三）业务经办管理机构下设22个业务经办机构：第一分中心下设城中服务部、城西服务部；第二分中心下设城南服务部、天府新区服务部；第三分中心下设城北服务部、城东服务部；第四分中心下设龙泉驿服务部、简阳服务部、金堂服务部、东部新区服务部；第五分中心下设温江服务部、都江堰服务部、崇州服务部、大邑服务部；第六分中心下设双流服务部、新津服务部、邛崃服务部、蒲江服务部；第七分中心下设郫都服务部、青白江服务部、新都服务部、彭州服务部。

四川省省级住房公积金管理中心、四川石油管理局住房公积金管理中心加挂成都住房公积金管理中心分中心牌子，在授权管理下独立运作。