东南早报基于早报市民化的特点，编辑部明确报纸应以平民视角关注社会热点，以“短、快、新”为特色，满足都市里的中青年读者的信息要求；开设了新闻热线，接受市民反映的各类信息和咨询、投诉，并专辟版面进行报道。泉州新闻是早报的采编重点，创刊以来，由原先的2个版扩为3个版，本地的信息量不断增加，尤其是服务性更强；东南新闻是东南早报的特色版面，东南早报发挥驻外记者的优势，对泉州周边城市的新闻进行有选择的报道，并由原先的1个版扩为3个版。从2001年起，为完善东南早报的版面结构，丰富早报内容，编辑部又增辟具有专副刊性质的双休周末版。

如今，每周一至周五，东南早报以绝大多数的版面保证对国内外热点新闻的充分报道；以最强的采编阵容，追求最具竞争力的本埠新闻；双休日辟有新闻版块和周末版块，周末版又分为周六的清香版和周日的温馨版，清香版主要是以身边经济的报道为重点，教人理财，让人了解财经动态；温馨版则注重情感倾诉，营造温馨的家庭气氛，提供实用的生活资讯。