1927年10月12日，成立儋县临时革命政府。其他工作机构也相应成立，内设秘书科、财政科、教育科、政警队、警察署。同月27日临时革命政府向光村革命根据地转移。

1942年7月，临高与儋县合县，在临高县和舍镇成立临儋联县办事处。内设民政科、财政科、军事科、教育科（每科皆设正副科长），秘书科设秘书一名。同年10月，临儋联县办事处分开，儋县联乡办事处于洛基乡大域村（今属西流农场）成立。主任王怡亭，军事科改称保安科。

1943年9月初，撤销儋县联乡办事处，成立临儋联县抗日民主政府（驻于和民乡略茂、东成乡黄泥等村），撤销教育科，由民政科兼管教育事务。次年5月，两县抗日民主政府又分开，儋县抗日民主政府于三区太平乡丰猛岭成立。政府工作机构有所变动，内设司法科、财建科、粮食科（供给科）及秘书。1945年8月抗日战争胜利后，儋县抗日民主政府改称儋县民主政府。1948年2月中旬，在儋县、白沙和昌江县之间地区成立海山县民主政府，1949年2月撤销，人员并入儋县民主政府。

1950年5月，海南解放，儋县民主政府改称儋县人民政府，县城设于新州镇。所属办事机构有秘书室（后改为办公室）、民政科、文教科、农建科、人民法院、财政科、粮食局、税务局、人民银行。1951—1953年，设立监察委员会、人事科、卫生科、气象站、计划统计科，工商科、手工业科、供销合作联社、邮电局。

1955年6月，在县城新州镇召开儋县第一届第二次人民代表大会，将人民政府改称人民委员会。而后成立检察院、文化科、劳动科，把监察委员会改称监察室、工商科改称商工科。

1956年9月，上级批准将原儋县划分为儋县和那大办事处。办事处设办公室、人事局、教育局、卫生科、计划委员会、财政局、粮食局、手工业局、人民法庭、人民检察院。儋县人民委员会增设办公室、林业科、交通科、长坡糖厂（属广东省直辖企业）、保险支公司。

1957年5月，成立那大县，相应设立热作科、林业科、商业局、服务局、邮电局。儋县成立侨务科。6月把商业局再分为商业局和服务局。

1958年4月，在县城那大镇召开那大县第一届人民代表大会，选举产生那大县第一届人民委员会。5月，儋县在县城新州镇召开第三届人民代表大会。尔后成立档案馆、农机局、通用机械厂、开发局，把水产科改称水产局、公安局改称公安政法部、商业局和服务局合并为商业局。1958年12月，撤销那大县而并回儋县。

1959年，成立科学技术委员会、物资供应站、对外贸易科、甘蔗指挥部蔗糖办公室；把卫生科纳入文教卫生部、民政科改称社会福利部、热作局改称外贸基地局、林业科改称林业局、劳动科改称劳动局、财政科改称财政局、交通科改称交通局、手工业科改称手工业局。

1960年，成立物价局。把社会福利部改称民政局，文教卫生部分出文教局和卫生局，公安政法部复称公安局，对外贸易局分设外贸基地局。1961—1962年，成立经济委员会，把气象站改称气象服务站、外贸基地局改称五料作物管理局、物价局改称物价委员会。

1963年，成立工商行政管理局，把侨务科改称侨务局、文教局改称教育局和文化局。1964年，成立中国农业银行儋县支行，把人事科改称人事局、物资供应站改称物资局。

1966年5月，“文化大革命”运动开始，初期县人委及各组织机构尚能坚持工作。1967年1月后，遭受冲击而处于瘫痪状态之中。1967年5月实行军事管制。军事管制委员会下设办公室、档案局、侨务局、民政局、教育局、文化局、卫生局、农村工作部、农林水办公室、气象服务站、五料作物管理局、农业局、水产局、林业局、水电局、劳动局、科学技术委员会、计划委员会、物价局、物价管理委员会、物资局、统计局、公安局、外贸局、财政局、财经委员会、商业局、工商行政管理局、粮食局、税务局、海南那大矿站、供销合作社、经委、交通局、工业局、手工业局、农械局、农机局、邮电局、保险公司、农业银行、人民银行等。

1968年8月29日，成立儋县革命委员会，下设“四大组”、“八个工作站”等工作机构，代替原来的县委、县人委工作职能。四大组——办事组、政工组、生产组、保卫组。八个工作站——宣传站、商业供销站（后分出粮油站）、财税金融站、农村水站、卫生站、水产站、农机站、工交站（1969年8月后把工交站分设为工业站、交通站，共十个组）。1973年5月撤销四大组、十个站，恢复部、委、办、局和县委、县革委办公室（一个机构两个印章，一套人马，内设战备组和统侨组），成立人事科、档案馆、侨务办公室、民政局、外事办公室、科教办、教育局、文化局、体委、科技局、卫生局、计划生育委员会、农林水办、气象局、热林局、农业局、水产局、水电局、计划委员会、劳动局、物资局、物价领导小组、统计局、政法委员会、公安局（又设教导员，正局级）、财贸办公室、商业局、外贸局、财政局、税务局、市场管理办公室、工商行政管理局、粮食局、海南那大矿站、供销合作联社、人民银行、保险公司、农业银行、城镇建设委员会、环境保护办公室、工交办公室（后与计委合并称计划委）、工业局、交通局、农机局、手工业局、邮电局、糖办（糖蔗生产办公室）、知青办、五·七干校等。

1976年10月，粉碎“四人帮”，结束“文化大革命”，政府工作机构陆续恢复和完善：设立儋县人民法院、革委会办公室、县革委会科教办、县革委会农林水办公室、县革委会知青办公室等。1979年8月，科教办改称文教办。

1982年10月15日，儋县革命委员会改称儋县人民政府，与县委分开，设有人事局、劳动局、外事办、档案局、侨务办、对台办、宗教科、民政局、教育局、文化局、那大中学、卫生局、科技局、科委、地震办、气象局、广播电视局、农业局、林业局、水电局、物价局、统计局、公安局、司法局、老区办、外经委、口岸办、对外信托公司、新源企业贸易总公司、商业局、财政局、税务局、工商局、粮食局、经委、手工业局、交通局、工轻局、农机局、邮电局、糖蔗生产办公室、农机一厂、农械公司、医药联合公司、建设银行县支行、农业银行县支行、人民银行县支行、人民法院、人民检察院等。

1984年，机构有卫生学校、第一人民医院、那大二中、新州中学（以上均为副科级）、教师进修学校、农委、计划生育委员会、热作局（由热作总公司改称）、联营开发公司、农村集体企业总公司、物资总公司（由物资局改称）、对外贸易公司、开发建设总公司、环宇工贸联合公司、审计局、供销合作联社（由供销合作社改称）、盐务局、交安办、矿产开发公司、人民保险公司儋县支公司、建设委员会（由基本建设局改称）、环境保护局（由环境办改称）。1985年，成立县志办公室、中旅社、广播电视大学儋县分校、机械公司（由农机一厂改称）。1986年，成立防疫站（副局级）、国土局、对外经济发展公司、天然气利用公司、中国银行儋县支行。

1987—1990年，增设旅游局、乡镇企业管理局（由农村集体总公司改称）、养虾办、对外经济贸易集团公司、计量管理局、化工局等。1990年底，全县常设办、委、局机构共79个，其中行政单位54个，企事业单位25个。

1994年，经过机构改革，市人民政府组成部门22个。2000年，机构改革，市政府共设20个工作部门。2008年，机构改革，市政府共设27个工作部门。