前身溯源

1929年，莆田职业中学在莆田县城北较场旧都司署成立。1941年，学校改成莆田私立东山高级职业学校。1947年8月，改名为莆田私立东山高级土木科职业学校。1951年7月，改名为莆田私立东山土木工程学校。1956年，省政府接办莆田私立东山土木工程学校，改称福建省水利学校。

1956年7月，学校迁至永安，改名为福建水利电力学校，为中华人民共和国成立后三明境内最早的中专学校。1958年，学校改名为福建水利电力专科学校。1960年，福建水利电力专科学校改为福建水利电力学校（又说升格为福建水利电力学院，并于1961年撤销）。

整合发展

2003年2月，经福建省人民政府批准，升格为福建水利电力职业技术学院。2006年以优良成绩顺利通过福建省教育厅组织的高职人才培养工作水平评估。2013年3月4 日，被福建省教育厅、发改委、财政厅确定为“福建省示范性高等职业院校”，是福建省第二个通过验收的省级示范性高等职业院校。

2019年7月，被教育部认定为国家优质专科高等职业院校。

2022年起，福建水利电力职业学院将首次试点，依据台湾科技院校四年制及专科学校二年制联合统一测试（简称“统测”）成绩，招收台湾高中毕业生攻读本专科。