前期准备

1984年，中华人民共和国国务院批准的《福州市城市总体规划》（1980～2000年），仅考虑了地面电汽车公交。

1988年，新加坡国际发展与咨询私人有限公司在对《福州市城市总体规划（1988～2020年）》（以下简称《总规》）的咨询报告中提出了建立东西向和南北向高架轻轨电车的设想。

1990年，《总规》调整时，出于时城市多层次主体交通的考虑，提出了在已规划的高架轻轨基础上，有必要为地下轨道交通预留足够的地下空间走廊，但此建议未受到重视。

1991年，《福州市城市公共交通发展规划（1990～2020年）》认为原规划的呈十字型的轻轨线不能满足中、远期交通需求，应增设环状轻轨线路，仍未触及地铁规划问题。

1994年，有学者提出采用“辐射线+环线”形式的地铁布局，与人防工程结合，并与高架轻轨相结合。

1995年，福州开始轨道交通规划的具体运作，在城区规划了6条主线和2条支线。

1997年至1999年，有学者对福州建立高架快速轻轨交通进行了构想和可行性分析。

2002年7月，福州市规划局和上海交研所共同编制了《福州市轨道交通网络规划》，围绕建设“一中心六组团”的城市布局结构，初步提出远景形成两纵一横一环（4条线）网络架构，总长约136·2千米。

2007年下半年，福州市有关部门组织专家对《福州市轨道交通网络规划》（修编）进行了商讨和论证，推荐的线网方案由7条线组成，线路总长为193·83千米；9月，福州市政府批复同意了《福州市轨道交通网络规划》修编，为加快推进前期工作，市政府还成立了以郑松岩市长为组长的福州市城市轨道交通建设领导小组，下设办公室挂靠市发改委开展工作，具体负责福州城市快速轨道交通网络规划工作。

第一期建设规划

2009年6月，中华人民共和国国家发展和改革委员会以发改基础〔2009〕1467号文印发经中华人民共和国国务院批准的《福州市城市快速轨道交通近期建设规划（2008～2016年）》，福州地铁1号线、福州地铁2号线获批；12月27日，福州地铁1号线白湖亭站试验段举行动工仪式。

2010年1月，中华人民共和国国家发展和改革委员会以发改基础〔2010〕66号文批复《福州市轨道交通1号线工程可行性研究报告》。

2011年1月17日，福州地铁1号线工程（一期）初步设计获福建省发展和改革委员会正式批复；4月26日，福州地铁1号线一期工程全面展开施工。

2012年11月，中华人民共和国国家发展和改革委员会以发改基础〔2012〕3532号文批复《福州市轨道交通2号线工程可行性研究报告》。

2013年1月，《福州市城市轨道交通线网规划（2012年修编）》（送审稿）专家咨询会举行，会上，修编后的福州市城市轨道交通远景线网中，规划线路拟从此前的7条扩至10条；12月，福州市有关部门完成城市轨道交通线网规划修编及第二轮建设规划，启动第二轮城市轨道交通建设规划报批工作，根据修编方案，该线网规划线路由9条轨道交通组成，新增福州地铁8号线、福州地铁9号线两条线，原规划线路最终走向、站点位置也有部分调整。

2014年3月18日，福州地铁2号线工程初步设计获福建省发展和改革委员会正式批复；3月19日，福州地铁1号线工程（二期）初步设计获福建省发展和改革委员会正式批复；11月28日，福州地铁2号线举行开工仪式，金祥站和厚庭站率先开工。

2015年12月30日，福州地铁1号线一期南段开始空载试运行。

2016年5月18日，福州地铁1号线一期南段开通初期运营，福州市成为中国第27个（中国内地第24个）开通运营地铁的城市；9月28日，福州地铁1号线一期北段开始空载试运行；11月29日，福州地铁2号线机电设备ppp项目特许经营初步协议签约仪式举行；12月25日，福州地铁1号线全线开放试乘。

2017年1月6日，福州地铁1号线一期北段开通初期运营。

2019年1月20日，福州地铁2号线开始空载试运行；4月26日，福州地铁2号线开通初期运营。

第二期建设规划

2015年12月31日，中华人民共和国国家发展和改革委员会以发改基础〔2015〕3170号文批复《福州市城市轨道交通第二期建设规划（2015～2021年）》，福州地铁4号线一期工程、福州地铁5号线一期工程、福州地铁6号线获批。

2016年8月30日，福建省发展和改革委员会批复《福州市轨道交通6号线工程可行性研究报告》；11月30日，福州地铁6号线举行开工仪式。

2017年3月28日，福建省发展和改革委员会批复《福州市轨道交通5号线一期工程可行性研究报告》；6月29日，福建省发展和改革委员会批复《福州市轨道交通4号线一期工程可行性研究报告》；9月29日，福州地铁6号线工程初步设计获福建省发展和改革委员会正式批复。

2018年8月24日，福州市发展和改革委员会公示《福州市城市轨道交通线网规划（2012年修编）调整》，福州地铁2号线从鼓山站东延至马尾港站，福州地铁4号线二期予以取消，福州地铁6号线从万寿站东调至国际学校站。

2019年6月18日，中华人民共和国国家发展和改革委员会以发改基础〔2019〕1074号文批复《福建省海峡西岸城际铁路建设规划（2015－2020年）调整》，福州至福州长乐国际机场城际铁路（福州地铁滨海快线）获批；6月20日，福建省发展和改革委员会批复《福州市轨道交通4、5号线一期工程可行性研究调整补充报告》；7月30日，福州地铁5号线一期工程初步设计获福建省发展和改革委员会正式批复；8月6日，福州地铁4号线一期工程初步设计获福建省发展和改革委员会正式批复；11月14日，福建省发展和改革委员会批复《福州至福州长乐国际机场城际铁路工程可行性研究报告》；12月27日，闽东北协同发展区城际铁路f1线（福州地铁滨海快线）举行开工仪式。

2020年4月7日，福州至福州长乐国际机场城际铁路工程初步设计获福建省发展和改革委员会正式批复；7月2日，中华人民共和国国家发展和改革委员会以发改基础〔2020〕1050号文批复《福州市城市轨道交通第二期建设规划调整》，福州地铁2号线东延线工程、福州地铁6号线东调段工程获批。

2021年3月8日，福州地铁6号线长乐段开始空载试运行；11月17日，福建省发展和改革委员会批复《福州市轨道交通6号线工可调整暨6号线东调段工程可行性研究报告》《福州市轨道交通2号线东延线一期工程可行性研究报告》；12月18日，福州地铁5号线一期首通段开始空载试运行；12月28日，福州市人民政府召开新闻发布会，明确福州地铁5号线、福州地铁6号线2022年开通初期运营，福州地铁2号线东延线、福州地铁6号线东调段2022年一季度可动建。

2022年3月15日，福州地铁6号线全线开始空载试运行；3月21日，福州市人民政府网站公示《福州城市轨道交通线网规划（2021年修编）》，优化了福州地铁4号线、福州地铁5号线、福州地铁6号线方案，调整了福州地铁3号线、原福州地铁7号线（新11号线）、原福州地铁8号线（新10号线）方案，在主城区范围加密了福州地铁7号线、福州地铁8号线、福州地铁9号线，福州滨海新城范围加密了福州地铁12号线、福州地铁13号线，新增s1-s6市域轨道交通线路；3月24日，福州地铁6号线工程初步设计调整暨6号线东调段工程初步设计获福建省发展和改革委员会正式批复；3月28日，福州地铁2号线东延线一期工程初步设计获福建省发展和改革委员会正式批复；4月29日，福州地铁5号线首通段投入初期运营；6月30日，福州地铁2号线东延线工程开工；7月5日，福州地铁6号线东调段开工；8月28日，福州地铁6号线投入初期运营。

第三期规划建设

2022年12月消息，福州地铁第三期规划建设正在进行环境影响评价公众意见征询，本期建设规划共5个项目线路总规模约138·1公里，包含福州地铁3号线一期、福州地铁4号线二期、福州地铁6号线西延、福州地铁8号线和福州地铁s1线一期工程，以及配套的车辆段、停车场、车站、主变电所等相关工程，线路总规模约138·1km。

2023年4月13日，福州市城乡建设局通报一季度轨道交通建设最新进展，2023年福州市在建轨道交通工程共5项，计划投资99亿元，在建里程138·4公里；一季度已累计完成投资26·6亿元，完成年度计划的27%，超序时进度2个百分点；其中，福州地铁4号线首通段、福州地铁5号线后通段已进入试运行阶段，预计2023年年底可投入初期运营；福州地铁2号线东延线8座车站已全部动工，1个车站已完成主体结构封顶，盾构区间累计完成总量的9·4%；福州地铁6号线东调段5座车站已全部动工，正进行盾构掘进施工前准备工作；福州地铁滨海快线15座车站中10座完成主体结构封顶，盾构区间及隧道累计完成总量的73%，15·2公里高架桥已完成13·7公里；福州地铁6号线东调段2026年9月初期运营；5月4日上午，随着最后一块顶板浇筑完成，由中铁八局承建的福州地铁6号线东调段十八孔闸站站前段顺利完成主体结构封顶，成为全线首个实现阶段性封顶的车站。

2025年3月26日，从福州地铁获悉，2025年，在建的滨海快线开通后将新增3座高架车站，分别是帝封江站、祥谦站和首占站。