1984年4月，在原广东省农村经营管理干部学校的基础上筹建广东省农业管理干部学院，同时将广东省农业科技干部进修班并入其中。

1985年9月，广东省人民政府批准同意成立广东省农业管理干部学院，并于当年开始招收大专生。

1986年3月，经国家教委备案，正式成为成人高等学校。

1999年，经省教育厅同意开始高职专业试点招生。

2006年4月，广东省人民政府批复同意在广东省农业管理干部学院的基础上设立广东科贸职业学院，同年5月在教育部备案，成为高等职业技术学院，隶属省农业厅管理。

2008年7月，广东省人民政府批准学院划转省教育厅管理。

2011年底，通过广东省教育厅高职院校人才培养工作评估。

2013年11月，被广东省教育厅、广东省财政厅确定为第三批广东省示范性高职院校立项建设单位。

2017年5月，学校入选农业部“首批全国新型职业农民培育示范基地”。

2018年8月，学校获批教育部第三批现代学徒制试点单位。

2020年5月，学校被确定为广东省示范性高等职业院校。

2021年5月，学校被农业农村部、教育部联合推介为“乡村振兴人才培养优质校”；9月，通过教育部现代学徒制第三批试点验收。

2022年8月8日，学校拟立项为广东省域高水平高等职业院校建设计划建设单位。