部门内设民族科、宗教科、寺院管理科等6个职能科室，统筹管理青海省藏语系佛学院果洛分院。核心职责包括：

研究制定民族工作政策

推进民族团结进步先进州建设

协调处理民族宗教领域重大问题

组织实施寺院社会化管理考核

2023年度决算报告显示，部门财政拨款支出主要用于统战事务、社会保障和民族宗教专项工作。