各设区市、高新区可根据工作需要并经有关程序设立分支机构。协会分支机构可以称分会、工作组或工作委员会等。协会分支机构是根据本协会的特点而设立，是本协会下属的办事机构，其主要任务是贯彻协会的重大决策并完成协会分配的工作，更好的服务于区域协会会员，促进高新技术企业又好又快发展。

协会设立分支机构应当得到协会秘书处批准，并按照本协会章程规定开展工作。协会分支机构需经协会法人授权（以法人委托书形式授予负责人工作职权）才可开展协会分支机构的日常工作。

协会分支机构的活动经费由当地主管部门资助或其它渠道获得。