（一） 办公室

负责机关文电、信息、安全保卫、保密工作；负责机关日常工作的协调和督查；负责突发环境事件应急、预警工作;承担政务公开、新闻发布工作；组织、指导和协调环境保护宣传教育工作。

（二） 污染防治科

拟订大气、水、噪声等专项环境功能区划；拟定重要饮用水水源地、重点区域、流域、地下水污染防治规划并监督实施；对大气、水体、城区土地、噪声、固体废物、化学品以及机动车等污染防治实施统一的监督管理；负责危险废物经营许可和监督管理，组织实施危险废物申报登记制度；建立和组织实施跨界水体断面水质考核制度；监督管理饮用水水源地环境保护工作；负责城市环境综合整治工作。负责对固体废物污染环境的防治工作实施统一监督管理。负责环境监测和信息工作；建立环境质量监测管理制度;组织开展环境监测，对全市环境质量状况进行调查评估并预测预警；组织编制环境质量报告书和环境状况公报，负责发布环境信息；组织建设和管理全市环境监测网和环境信息网；对环境监测实施统一监督管理。牵头协调本辖区重特大环境污染事故的调查处理；协调跨区域环境污染纠纷；负责跨区域的重大环境问题的统筹协调和监督管理。组织开展清洁生产强制性审核工作；负责企业上市和上市企业再融资的环境保护核查工作。

（三）污染物排放总量控制科

承担落实国家和省、市减排目标的责任。建立并组织实施总量减排责任制考核制度；拟定总量控制计划；监督检查污染物减排任务完成情况；组织实施主要污染物排放总量控制和排污许可证制度，提出总量控制计划建议；组织实施环境保护目标责任制；承担环境统计和污染源普查工作；负责组织编制并发布环境统计年报和统计报告；组织开展排污权交易；对新建、扩建项目污染物排放总量进行调控管理。

（四）规划财务科

组织制定全市环境保护规划和年度计划，并监督实施；参与制定全市经济和社会发展规划及年度计划；负责环保专项资金的使用管理；承办国家、省市补助的环保系统项目的审核；会同财政部门编制环保补助资金计划；承担局机关和所属单位的国有资产管理、财务和内部审计工作。

（五）环境影响评价科

承担从源头上预防、控制环境污染和环境破坏的责任。审查开发建设区域规划、行业规划环境影响评价；负责审批权限内建设项目的环境影响评价文件；负责市级审批的建设项目竣工环境保护验收；对环境影响评价机构的资质进行管理；负责环境影响后评价工作；组织开展建设项目施工期的环境监理工作；负责区域、流域限批政策的落实

（六）自然生态保护科（挂生态市建设办公室牌子）

组织拟订生态市建设规划、年度计划、工作目标并负责综合、协调、监督实施工作；指导生态县建设规划的编制；指导、协调、监督全市生态保护工作；组织编制生态保护规划；组织评估生态环境质量状况；提出新建的各类自然保护区申报建议，对自然保护区、风景名胜区、森林公园的环境保护工作进行监督；监督生物多样性保护、野生动植物保护、湿地保护、荒漠化防治工作；指导农村环境综合整治、生态示范建设；调查处理重大生态破坏事件；牵头生物物种（含遗传资源）工作，组织协调生物多样性保护；监督管理农村土壤污染防治工作。

（七）辐射安全管理科

承担核安全、辐射安全、放射性废物和固定废物管理工作；拟定有关方针、政策和法规；承担核事故、辐射环境事故应急工作；对电磁辐射、核技术应用、伴有放射性矿产资源开发利用中的污染防治实行监督管理。承担环境保护科技工作；参与拟订环境保护科技发展规划与计划；管理环境保护科研项目和成果；推动环境技术管理体系建设；组织环境保护重大科学研究和技术示范工程；指导和推动循环经济、清洁生产和环境保护产业发展 。

（八）政策法规科

监督环境保护规划、政策、法规、标准的执行；组织草拟市级环境保护法规和行政规章；组织制订全市排污收费法规、规章和管理办法；承担局机关规范性文件审查工作；负责行政复议和行政应讼工作；负责全市环境保护法律、法规培训；负责信访工作；负责开展环境保护对外合作交流工作。

（九） 嫩江水系污染防治领导小组办公室

监督嫩江流域的各级人民政府及排污单位贯彻执行《中华人民共和国环境保护法》、《中华人民共和国水污染防治法》及其实施细则，治理水污染源；对流域内跨地（市）盟的水污染问题进行协调、监督、管理；参与嫩江流域对水环境有影响的大型工程的评价、审查；监督有关单位执行“三同时”制度，防止水污染；对嫩江流域重大污染事故，依法进行水污染防治方面的调查，并参与处理意见；拟定嫩江流域水污染防治规划并监督实施；监督流域内各级人民政府及部门贯彻执行排污申报登记制度，污染物排放总量控制和排污许可证制度；对嫩江流域的饮用水源地进行监督管理。

机关党委

负责机关、直属单位的机构编制、人事管理和干部管理工作；负责直属单位的党群工作；负责机关、直属单位的出国人员政审工作；负责机关离退休干部管理和服务工作；负责县(市)环保部门领导干部双重管理工作；负责局机关党群工作。