1680年，前门“源升号”酒坊的酿酒技师赵存仁、赵存义、赵存礼三兄弟为纯净烧酒质量，进行了大胆创新，发明了“掐头去尾取中段”的摘酒工艺，二锅头酿制技艺由此诞生。

1949年5月，华北酒业专卖公司实验厂成立（红星前身），根据国家对酒实行专卖的要求，成立后的实验厂全面收编了“源升号”、“龙泉”、“同泉涌”、“永和成”等12家京城老字号作坊，汇集了酿酒技术和人才，全面独家嫡传北京二锅头酒传统酿造技艺。

1949年9月，红星酿制出第一批瓶装二锅头，作为迎接新中国诞生的献礼酒。并命名为红星二锅头。红星二锅头作为商品名称，开创了以酿酒工艺命名产品的先河。红星成为北京二锅头品类始创者。

1949年10月，由于出色完成献礼酒任务，红星光荣参加开国大典，成为唯一获此殊荣的白酒企业。

1965年8月，北京酿酒总厂(红星前身)受政府委托，归口管理顺义牛栏山酒厂、昌平酒厂等19家郊县酒厂、在“七管两不变”的管理模式下，输出酿酒技术和人才，扶持帮助他们发展二锅头生产。

1997年，红星二锅头酒被国家技术监督局认定为二锅头酒国家实物标准样，这代表着红星为二锅头酒质量的标杆。

2006年，红星被商务部授予“中华老字号”的荣誉，是全国第一批获此殊荣的企业之一。

2008年，红星申报的“北京二锅头酒传统酿造技艺”入选“国家级非物质文化遗产名录”。北京二锅头酒传统酿制技艺第八代传人高景炎（红星原厂长）被国家文化部认定为该技艺的代表性传承人，成为该技艺唯一的国家级代表性传承人。

2019年，红星完成两大厂区升级改造及建成投产。11月，红星怀柔厂区升级改造完毕，成为一座集生产、文化旅游、科研于一体的二锅头大型文化产业园区；位于山西祁县清香白酒核心产区的红星六曲香分公司新园区也于2019年顺利建成投产，作为集酿造、生产、储存及工业旅游为一体的国家级非遗二锅头传承基地。

2020年，中国酒业协会发布了《二锅头酒团体标准》，红星是该标准的主要制定者之一。

2022年，红星内设的首家以二锅头品类为主要科研对象的酒类研究院——北京二锅头酒研究院投入使用，致力于全面提升北京二锅头的品质和品类价值。

2022年，红星使用自有资金，在山西汾河流域，分期建设占地近千亩、年产原酒11·5万吨、储存能力13·5万吨的智能化、生态化的“红星二锅头酿造基地”。11月7日，“红星二锅头酿造基地"一期工程建成投产。

2022年，红星成功入选北京市经济和信息化局颁发的2022年度“北京市智能工厂”名单。

2023年，红星荣获工信部工业节能与绿色发展评价中心授予的“国家绿色示范工厂”荣誉称号。在打造智能工厂的同时，红星也积极响应国家绿色生产、清洁生产的号召，充分利用能源管理系统、余热利用系统、污水处理系统、废气处理系统、太阳能光伏发电系统等，提高能源的配置效率，实现了厂房集约化、原料无害化、生产洁净化、废物资源化、能源低碳化等目标。