1950年11月14日，中南农业科学研究所成立，为新中国最早成立的6个大区性农业科研机构之一。

1955年3月，中南农科所改组为华中农科所，隶属于农业部，主要服务湘、鄂、赣3个省。

1958年元月，华中农科所与湖北省农业综合试验站合并成立湖北省农科所，划归湖北省领导。

1978年元月，湖北省委将省农科所、省畜牧特产所和省蚕种场合并设立了湖北省农业科学院。

2006年，湖北省政府依托湖北省农业科学院组建湖北省农业科技创新中心。