院徽突出省农科院“创新”“绿色”核心理念。以圆形结构为基础，有内外两圈。外圈由“湖北省农业科学院”中英文全称构成。

内圈上部以湖北地标黄鹤楼作为图形要素，以湖北地图作为背景，体现了农科院地处湖北的历史底蕴和地域特色，也体现了农科院面向湖北和全国，“建一流强院”的发展定位；内层下部由稻穗、麦穗、河流、田野、院英文简写构成，以色彩和线条的融合，勾勒出农科元素，展现了省农科院“情系三农”的情怀。

院徽由深绿、浅绿和黄色组成。深绿，象征严谨和理智；浅绿，象征活力和希望；金黄，象征阳光和丰收。绿色黄色的结合体现了农科院通过科技创新，开拓进取，为湖北“三农”发展贡献力量。