中华民国30年（1941年）在剑阁县城（今普安镇）成立四川省剑阁县地方法院检察处，履行实施侦查、提起公诉、监所检察、监督刑事裁定的执行等职能。

中华人民共和国成立后，1952年1月28日，剑阁县人民检察署在县城城关镇（今普安镇）成立。1955年2月更名为剑阁县人民检察院。

“文化大革命”期间，1966年至1968年，剑阁县公安局与剑阁县人民检察院、剑阁县人民法院一起实行军事管制，合称"剑阁县公、检、法军事管制委员会"；1968年5月，其检察职能被剑阁县公、检、法军事管制委员会和新成立的剑阁县革命委员会人民保卫组取代。1972年9月，剑阁县人民检察院撤销，检察权改归剑阁县公安局行使。1978年8月10日，剑阁县人民检察院恢复设立。

1981年，剑阁县人民代表大会常务委员会决定县检察院设四科一室。2001年检察机关机构改革后内设机构12个，定编65人，其中政法行政专编60人，事业编制5人。

2004年9月28日，剑阁县人民检察院机关随剑阁县城搬迁而由原址普安镇闻溪路10号迁至现址下寺镇修城坝横五路办公。