（一）办公室。负责机关文电、会务、机要、档案等机关日常运转工作。承担信息、宣传、安全保密、信访、政务公开、财务和后勤保障管理等工作。承担重要文稿的起草和审核有关工作，对审计成果进行整理研究和综合利用。牵头办理人大代表建议和政协提案；联系特约审计员。

（二）综合计划科。协调落实全市审计机关审计项目计划统筹，负责拟订全市统一组织的审计项目计划和局年度审计项目计划，审核县（市、区）审计机关审计项目计划，指导、监督检查县（市、区）审计机关审计项目计划管理情况。组织开展涉及全局或行业性的重点资金和重大项目审计。组织审计有关重大政策措施和宏观调控部署贯彻落实情况。负责全市审计统计工作。

（三）法规审理科。起草有关地方规范性文件、规章制度草案和审计指南。参与起草财政经济及其相关的规范性文件。组织审定县（市、区）审计机关拟向本级人大常委会提出的本级预算执行和其他财政收支情况审计工作报告。审理审计业务事项。监督检查全市审计机关审计业务质量，依法纠正或责成纠正县（市、区）审计机关违反国家、省和市规定作出的审计决定。负责对重大违纪违法问题线索的移送协调。承担局机关有关规范性文件的合法性审核工作。开展法规咨询，组织实施全市审计机关的普法工作，组织向社会普及审计法律法规工作。承担有关行政复议、行政应诉等工作。推动建立健全内部审计制度，对市直部门和企事业单位内部审计机构进行业务指导，监督内部审计职责履行情况，检查内部审计业务质量。组织核查社会审计机构对依法属于市审计局审计监督对象的单位出具的相关审计报告。负责审计刊物征订和组织发行。

（四）整改监督科。督促整改审计查出的问题，牵头起草各类审计查出问题的整改情况报告。

（五）经济责任审计科。组织开展领导干部经济责任审计工作。负责全市经济责任审计工作的协调、管理和业务指导工作。承担市经济责任审计工作领导小组办公室有关工作。

（六）财税金融审计科。组织审计市本级财政预算执行、决算草案和其他财政收支，组织审计各县（市、区）政府预算执行、决算草案及其他财政收支和市财政转移支付资金。组织审计市驻外非经营性机构的财务收支以及国际组织和外国政府贷款、援助项目的财务收支；承担有关专项境外审计工作；组织审计全市政府债务、隐性债务和其他相关债务。

（七）行政事业审计科。组织审计市直财政预算拨款单位及下属单位的预算执行情况、决算草案和其他财政财务收支。组织审计市直行政和市政府管理以及受市政府委托管理的行政、政法专项资金。组织审计市直相关部门及直属单位、县（市、区）政府管理的教科文卫体专项资金。

（八）农业农村和资源环境审计科。组织开展领导干部自然资源资产离任审计以及自然资源管理、污染防治和生态保护与修复情况审计。组织审计农业农村、扶贫开发以及其他相关公共资金和建设项目。指导和监督农村集体经济审计工作。

（九）固定资产投资审计科。组织审计市政府投资以及以市政府投资为主的建设项目以及其他关系到国家利益和公共利益的市属重大公共工程项目。组织审计市对口支援重大项目和资金。

（十）企业审计科。组织审计市属国有企业和市政府规定的市属国有资本占控股或主导地位的企业的资产、负债、损益及其境外国有资产投资、运营和管理情况。负责对市属国有企业主要领导人员的经济责任审计。

（十一）社会保障审计科。组织审计市政府相关部门、县（市、区）政府管理和其他单位受市政府及其部门委托管理的社会保障基金、社会捐赠资金以及其他有关基金、资金的财务收支。

（十二）组织人事科。负责局机关、直属行政单位和所属事业单位的干部人事、机构编制、劳动工资、教育培训、离退休人员服务和审计专业技术职称考评等工作。承担协管县级审计机关领导班子有关事项。承担协管全市审计机关有关机构编制事项。承担全市审计机关审计人员统一招录（聘）有关工作。承担全市审计机关审计职业化建设有关工作。负责机关和指导直属单位的党群纪检工作。指导全市审计机关党建工作。