办公室

负责重要文件的起草、信访、保密、安全和机关精神文明建设，规章制度的制定和监管，负责人事、财务、资产和车辆等管理，科技宣传和文字材料的综合，科技信息网络的管理，负责科技创先、科技进步考核等活动，做好科技档案、科技统计及职称评审，退休人员的管理服务等工作。

工业与高新技术处

实施工业类的国家、省、 市重大科技攻关计划、火炬计划、科技创新基金项目、高新技术重大产业化项目和高新技术项目、产品、企业的推荐、审核、认定。高新技术研发中心的申报、认定。高新技术改造传统产业和国家、省高新技术产业园区的建设与项目的实施。组织对市级重大科技计划项目的立项审核、科技项目的招投标工作和科技创新工程。 负责科技三项经费、科技创新资金和高新技术项目贴息资金等科技经费的管理使用。负责科学事业费的监管。

农业与社会发展处

组织全市农业、教育、医卫、社科等社会发展领域的科技攻关及其产业化项目的实施与管理。全市农业科技创新体系建设，运用高新技术改造传统农业，承担科技扶贫工作、科技下乡、科学技术普及，负责各级星火计划组织实施，创建星火示范乡镇，开展星火技术培训和农村科技人才的培养，负责国家星火技术密集区建设与管理。参与农业高新技术产业 园区(科技园)的建设与发展。