2000年，长春博文职业技术学校创办。

2007年，更名为吉林省博文职业技术学院。后又连续更名为长春理工大学成教学院博文分院、长春市博文中等职业技术学院。

2010年6月，更名为吉林科技职业技术学院，学校经教育部同意新设立予以备案。

2014年，学校当选中国职业技术教育学会民办教育分会“副理事长单位”。

2015年，学校被中国职业技术教育学会民办教育分会推选为副理事长单位，被吉林省人民政府确立为“高校教育战略性调研示范单位”。

2020年，学校入选“吉林省中华职教社改革创新实验校”。

2024年12月28日，吉林科技职业技术学院低空经济产业学院正式成立。

2025年6月19日，吉林科技职业技术学院数智会计工坊产业云学院揭牌成立。