1940年，原浙西三中教师陈鸿文等人，提议创办昌化县立初级中学，昌化县长董中生确定以三民乡（今龙岗镇）为建校地址，主持召开校舍筹建联席会议。

1941年3月，根据浙江省教育厅批示，“昌化县立战时初中补习学校“成立。

1943年3月11日，浙江省教育厅以中字第777号文件，正式命名为“昌化初级中学”。

1944年，原附设在补习学校的昌化县师训班另立为昌化简易师范。

1945年6月，浙江省教育厅批准，昌化初中与简易师范合并。

1956年初，浙江省教育厅正式批准学校增设高中部，改校名为浙江省昌化中学。

1960年，学校更名为临安县昌化中学。

1970年初，校舍被工厂占用，迁来昌化与原武隆初中合并，仍称昌化中学。

1974年11月15日，杭州市革委会批准将校址迁往南塔岭。

1990年，撤销初中部，成为普通高级中学。1999年12月29日，省教委下文认定“昌化中学为省三级重点中学”。

1999年12月29日，省教委下文认定“昌化中学为省三级重点中学”。

2002年，浙江省昌化中学被评为浙江省省二级重点中学。

2005年1月，浙江省昌化中学被评为浙江省省一级重点中学。