2025年4月13日，有博主在社交媒体发帖称，南京红山动物园工作人员给大熊猫“九九”打疫苗，致“九九”一只后腿无法行走，只能一瘸一拐走路。4月14日，南京市红山森林动物园在回应媒体时称，熊猫在接种疫苗过程中，碰到神经了。以后打疫苗会选择背部神经少的地方。上游新闻记者致电南京红山森林动物园，该动物园兽医处工作人员表示，大熊猫“九九”确实存在跛行的情况，但快康复了，“本来就不是大问题。”

2025年5月，一名网友在社交媒体发帖称，考拉馆入口处有“请牵手参观”标识，并强调“不牵手不能参观”，引发部分网友质疑真实性。该帖评论区出现调侃性互动，例如网友相约“下次去我们也牵手看”。红山动物园宣教部工作人员经现场核查确认：考拉馆原标识内容为“请在围栏外参观”，旨在提示游客保持安全距离；网传图片中的标识图案虽与园方图标一致，但文字内容被篡改；推测为个别游客自行替换标识，目前已恢复原版。