根据上述职责，共青团驻马店市委机关内设4个部（室）：

（一）办公室。综合协调团市委机关日常工作，负责团市委重要会议的会务工作；负责机关的综合调研、文秘档案、信访稳定、安全保密等工作；负责机关各项规章制度的制定完善落实；负责后勤服务、机关财务、资产管理等工作；指导和管理全市性青年社团组织；负责机关党的建设工作。

（二）组织部。拟订全市团组织、团干部和团员队伍建设规划并组织实施；负责全市团的组织建设、团干部培训、团员发展和管理工作；协助县区党委管理县区团委领导班子；协助市直机关党工委管理市直属单位团委领导班子，指导市直团组织建设；负责全市团费收缴、管理和团的基层组织统计工作；组织开展全市性先进基层团组织和优秀团员、优秀团干部的评选表彰工作，指导推动团的基层阵地建设和基层组织信息化工作；负责机关人事、机构编制等工作。

（三）宣传部。组织指导全市团员青年的思想政治工作；组织开展团的思想政治教育活动；指导全市团的宣传工作，抓好团的宣传队伍建设；指导团员青年理论学习；指导青少年活动阵地建设；指导开展健康有益的青少年文化、科技、体育活动；指导团的网络新媒体舆论阵地建设和网络舆论引导工作；做好全市青年统战对象的团结教育工作，负责市青年联合会的日常工作。

（四）青年发展部（学校部）。拟定促进青年发展的规划和政策措施，建立和完善青年服务体系，开展促进青年创业就业、创新创优和青年职业文明素养培养、技能培训提升等工作；组织引导团员青年在参与“五位一体”建设中发挥好生力军和青年突击队作用；指导全市青年工作，组织团员青年开展志愿者服务活动。组织指导全市高等院校和中学中职共青团工作；组织指导全市学校系统青少年思想建设、文化建设、社会实践和科技活动等；指导全市少先队工作，研究少年儿童的思想品德教育；指导少先队校外教育实践活动，推动少先队校外实践基地建设，组织开展有利于少年儿童健康成长的文化、体育活动；履行“全团带队”职责，加强青少年儿童思想引领，抓好少先队辅导员队伍建设；负责市少工委和市学联的日常事务工作；协助处理青少年权益的有关问题，维护青少年的合法权益。