栖霞市水源工程运行维护中心

承担跨区域跨流域水资源供需形势分析和水源工程调度、运行、维护；南水北调工程的建设、管理、运行、维护、固定资产管理；南水北调工程建设运行的技术支持服务保障；调引客水水量、流量的统计、确认、汇总、分析及上报；客水水费的测算、核算等工作。

栖霞市河长（湖长）制服务中心

承担河长制、湖长制日常工作、技术支持和服务保障工作。重点河道工程建设、运行、维护工作。承担水资源管理、水土保持防治等工作。

栖霞市龙门口水库管理中心

为水利工程正常运行提供管理保障。承担水库水利工程的建设、管理、养护等工作；承担水库防汛、安全生产、生态环境保护等工作。承担有关城市供水保障工作。承担辖区内农业灌溉应急抗旱服务工作。

栖霞市庵里水库管理中心

为水利工程正常运行提供管理保障。承担水库水利工程的建设、管理、养护等工作；承担水库防汛、安全生产、生态环境保护等工作。承担有关城市供水保障工作。承担辖区内农业灌溉应急抗旱服务工作。

栖霞市水利工程建设养护中心

水利工程建设及农村饮水安全工程运行维护的技术指导和服务保障；农业节水工程的规划设计及农业节水新技术新成果的推广应用；抗旱技术服务及深井定位、钻探钻井、井泵设计、配套安装等。