曲靖市司法局设16个内设机构（正科级）和政治部：

局办公室

政治部（警务处）

监察室

政策研究室

计划财务装备科

法制宣传科（曲靖市委依法治市领导小组办公室）

公证律师工作管理科

基层工作管理科

社区矫正工作管理科

国家司法考试工作科

司法鉴定工作管理科

法制科（行政复议办公室）

强制隔离戒毒工作管理科

监狱管理科

人民监督员管理办公室

曲靖市法律援助工作管理局（曲靖市法律援助中心）。