公路管理处

衢州市公路管理处于1985年成立，隶属于衢州市交通局的副处级事业单位。主要负责全市专业养护公路、县乡养护公路的工程管理、养护管理、路政管理。处机关内设办公室、人事教育科、工程管理科、养护管理科、路政管理科、资产管理科、财务科及总师室8个科室。直属有市高速公路路政管理大队、杭金衢高速公路常山超限运输检测站、市公路养护中心。下辖柯城、衢江、龙游、江山、常山、开化6个县（市、区）公路管理段。

道路运输管理处

衢州市公路稽征运输管理处成立于1987年8月，对外有衢州市公路稽征处、衢州市公路运输管理处两块牌子，一套人马，隶属于市交通局，属自收自支的事业单位，行政级别副县(处) 级。

港航管理处

衢州市港航管理处、地方海事局、航道管理处、船舶检验处，隶属衢州市交通局、浙江省港航管理局双重领导，是一个集水路运输管理、安全监督、船舶检验、航道管理、规费稽征等多种职能为一体的水上交通行政管理和执法机构，为四块牌子一套班子的全民事业单位。处办公大楼坐落在衢州市双港开发区亚美路255号。处机关设立办公室、海事科、财务科、船检科、运管科、航道科、直属所等科室，下属机构有龙游县港航管理所（龙游县地方海事处、龙游县船舶检验所），常山县港航管理所（常山县地方海事处），开化县港航管理所（开化县地方海事处），江山市港航管理所（江山市地方海事处）。

交通工程质量监督站

衢州市交通工程质量监督站（定额站）成立于1996年年底，是由市交通局授权，依据国家、省有关法规，技术规范等对全市在建交通工程质量进行强制性监督管理和造价控制的专职机构。

单位内设办公室、质量监督科、定额造价科、试验检测中心等四个职能科室，核定编制8人，实有职工21人，在编人员全部具有本科以上文化程度，具有较强的专业技术力量。

交通运输局前期办公室

樟潭公路收费站

航埠公路收费站

衢江公路收费站

汽车运输集团有限公司

交通建设集团有限公司

交通设计有限公司

衢州市交通设计有限公司是经国家建设部批准的具有公路行业（公路）甲级设计资质和勘察（岩土工程、工程测量）乙级资质设计单位，从事公路工程勘察设计以及公路工程技术咨询。为浙江省级文明单位、省级卫生先进单位。