泉州华侨历史博物馆主要展示泉籍华侨往海外移民及其在海外生存、发展的历史，反映华侨华人群体的主要特点和在人类文明发展中的地位、作用。该馆作为华侨史专题博物馆，藏品具有异域文化色彩，有较高的历史、文化、艺术与科学价值，是重现华侨先辈移民、谋生、发展历程的重要实物资料。截止2007年底，共有馆藏品（含展品）4459件，多数为华侨华人、归侨侨眷捐赠的传世文物，仅有少量从相关部门接收的出土文物。其中比较珍贵的主要有反映华侨华人史上各个时期重大事件、重要人物、著名侨领的文物史料，如“何香凝郭沫若叶恭绰合作画”、“陈嘉庚公司印尼泗水分公司提货单”、“梁披云墨宝《番客谣》”、印尼华侨“欢迎苏加诺总统莅锡签名册”、“缅甸同盟会会员吴宗海日记”等。

该馆设有“李成智华侨华人图书资料中心”，专门收集侨史资料和部分泉州地方史料，藏书已达8000多册，收藏有3种以上外文学术期刊，10多种中文学术期刊，数千册珍贵族谱、华侨华人社团刊物。