三明市档案馆保存着民国时期和建国后的档案203个全宗，58671个案卷，各种资料近2万册。

民国时期的档案主要有民国27年至38年福建省第六、第七、第九行政督察专员公署和国民党三元县党部、县政府、县参议会、司法处、警察局、自卫总团、邮政局等8个全宗，3586卷。主要内容有国民党党部，政府各种会议记录、训令、工作计划、视察巡视报告；政府公务人员的任免、考核、奖惩、训练；各种税收、司法的法规、法令、条例、规定及案件、表册等；特务情报、防匪、防谍、清乡、治安的实施计划，报告等；警察局及保警队组织规程、编制、任务；邮政业务的通令、报告、各种表报、清册。

建国后档案共有194个全宗，55062卷。这部分档案内容主要记述了三明由小小三元县历经三明重工业建设委员会、三明人民公社、三明市、三明专区（含三明地区革命委员会）至三明地区与地辖三明市合并组建省辖三明市，由人口不足万人的山区小县发展为初具规模的现代化工业城市的变迁、发展的真实历史。三明市档案馆还征集和接收了部份山林权证、人口普查、科研成果、纪检案件，财务会计、招商引资、贸易洽谈档案及中央、省级领导来三明检查指导工作及港澳同胞、华侨视察、访问三明的照片、录音、录像等反映三明两个文明建设的历程和成就的专门档案和音像资料。

馆藏资料有马列、毛泽东著作、政策法规汇编、中央、本省的党报党刊，三明地方报刊、杂志、统计资料和其它出版物，历史、哲学书籍和部分工具书，还有地方史志、家、族谱等。近几年来，还收集了三明创建文明城、卫生城、园林城、旅游城的部份资料及永安旅游节、沙县小吃节、宁化客家祭祖大典等活动的资料。

三明市档案馆为便于各方面对档案、资料的利用，编制了馆藏全部档案的案卷级和文件级目录900多册，为适应档案管理自动化的需要，已编制机检目录30多万条，可逐步实行计算机检索。还组织编写和印发了档案文件汇编和资料10多种，2千多册，可供查阅、利用。