1952年始建，神木信用合作社是神木县农业银行的基层机构，主要办理个人存款、贷款。1955年神木县发展为113个，1956年合并为87个，1958年又合并为22个，至1986年底，神木县22个乡镇各有1个信用合作社，下设业务站278个。

1984年，按照国务院105号文件精神，全国普遍筹备建立县信用联社，神木县农村信用合作联合社顺势而为，乘势而上，成立了神木县信用联社。

2005年1月13日，中国银行业监督管理委员会办公厅《关于筹建陕西神木农村合作银行的批复》（银监办发〔2005〕14号），同意筹建陕西神木农村合作银行，简称神木农村合作银行。

2005年，神木农村合作银行正式对外挂牌营业，成为西北五省第一家挂牌开业的农村合作银行。

2005年6月6日，中国银行业监督管理委员会《关于陕西神木农村合作银行开业的批复》（银监复〔2005〕144号），同意陕西神木农村合作银行开业。注册资本为人民币4300万元，为股份合作制的农村合作银行，实行一级法人、统一核算、分级管理、授权经营的管理体制。陕西省神木县农村信用合作社联合社及所辖农村信用合作社自行终止，其债权债务转为该行债权债务。

2005年6月6日经中国银监会批准，陕西神木农村合作银行是由辖内自然人、企业法人和其他经济组织共同发起的区域性股份制金融机构。

2005年8月，神木农村信用社首先改制为农村合作银行，成为西北地区首家农村信用社改制为银行的县级机构。

2009年3月，陕西神木农村商业银行获准筹建，陕西省农村信用社股份制改革正式启动。

2009年3月9日，中国银行业监督管理委员会《关于筹建陕西神木农村商业银行股份有限公司的批复》（银监复〔2009〕77 号），同意筹建陕西神木农村商业银行股份有限公司。

2009年9月8日，神木农村商业银行创立暨第一届股东大会在神木县召开，是陕西省首家由农村合作银行改制的农村商业银行，神木农村商业银行正式创立，成为西北五省第一家农村商业银行。

2009年12月23日，经中国银监会陕西监管局《关于陕西神木农村商业银行股份有限公司开业及董事高级管理人员任职资格的批复》（陕银监复〔2009〕39 号）批准，陕西神木农村合作银行改制为陕西神木农村商业银行股份有限公司。

2010年1月16日，神木农商银行正式挂牌营业，神木农村合作银行改制为农村商业银行，成为全省第一家农村商业银行和西北地区首家农村商业银行的县级机构。

2010年8月，推出“金贷通”信贷业务，发放“金贷通”贷款870笔，金额17·26亿元；

2013年8月，推出幸福生活系列消费信贷产品（公仆贷、园丁贷、医护贷、金领贷）

2013-08-14，神木农商银行推出“幸福生活”系列消费类贷款产品；

2013-08-16，提出“情系社会大众 打造幸福银行”的企业使命；

2014-01-01 ，陕西神木农商银行微信平台微官网正式投入使用；

2014年，推出了针对中小企业的“权利质押贷款”，通过股权质押的方式给予中小企业授信，丰富贷款方式

2015年，神木农商银行的微信公众号开通；

2015年，成立了金融扶贫领导小组，制定《金融扶贫实施方案》。针对当地的7000余户贫困户，该行通过上门调查摸底的方式，逐户了解致贫原因和脱贫方式，因地施策，因户施策，通过金融信贷支持贫困户脱贫

创新合作机制，与扶贫、农牧、林业、人民银行、财政、担保机构等合作，借助政府建立的“政府+人民银行+金融机构+担保公司”的“四位一体”金融扶贫模式，建立了扶贫担保专项基金，并组成了“政策组合+资金整合+金融创新”的扶贫联动机制。

2015年，先后在神木县柠条塔工业园区、二村工业园区、神东矿区、新村、九龙大道等厂矿、人员密集的区域加大网点布局。

2016年，把精准扶贫作为践行本土银行使命担当的重要工作，全面推行扶贫贷款“5321”模式（即贷款金额5万元以下，贷款期限3年以内，免担保、免抵押，利率优惠），向神木县建档立卡贫困户发放扶贫贷款296笔，金额3400万元，惠及贫困人口680多人。

2016年10月9日，重阳节，神木农商银行领导班子全体看望了“全国最美家庭”获得者贺俊花家庭。

2017-03-24，神木农商银行个人贷款微信申请平台开通。

2017-03-29，神木农商银行与神木县公安局联合推出的两座警银亭正式投入使用，警银亭分为警务亭和自助设备区两部分，是集公安民警值勤、银行离行式自助服务功能为一体的多功能综合服务设施，实行24小时不间断服务，“警银亭”外部安装视频监控设备2个，内部安装1个，对周边进行24小时全方位监控，顶部安有led显示屏，不间断发布交通安全、预防电信诈骗等防范宣传提示，内参照警务室建设标准，实施24小时值班制度，方便群众报警、求助。

2017-04-27，神木农商银行官网新版上线。

2017-09-25，神木农商银行微信申贷2·0版本全面上线。

2022年10月21日，榆林银保监局（榆银保监复〔2022〕85号）批复，辖属开发区分理处升格为“陕西神木农村商业银行股份有限公司榆神支行”，辖属北关分理处升格为“陕西神木农村商业银行股份有限公司北关支行。

2023年1月12日，榆林银保监局（榆银保监复〔2023〕1号）批复，辖属中鸡等8家分理处分别升格为陕西神木农村商业银行股份有限公司中鸡支行、西川支行、人民路支行、李家畔支行、黄庄支行、花石崖支行、尔林兔支行、东兴南路支行。

2024年10月12日《关于神木农商银行北郊分理处等14个分理处升格为支行的公告》：经国家金融监督管理总局榆林监管分局批复同意，神木农商银行北郊分理处、贺川分理处、栏杆堡分理处等14个分理处升格为支行。