1642年 崇德七年，伊拉古克三呼图克图、戴青绰尔济率西藏使团到达盛京。

1643年 崇德八年，二月癸未仲春始建寺。同年皇太极崩，顺治帝继位。

1644年 顺治元年，在建。同年满清入关。

1645年 顺治二年，乙酉六月仲夏告竣。

1743年 乾隆八年，乾隆皇帝御书“金镜周圆”匾额（今佚）

1778年 乾隆四十三年，乾隆皇帝亲临法轮寺礼佛，并留下御制诗文。

1783年 乾隆四十八年，乾隆皇帝亲临法轮寺礼佛，并留下御制诗文，谕敕封为“满洲喇嘛庙”。

1805年 嘉庆十年，嘉庆皇帝东巡盛京至法轮寺拜谒并留下御制诗文。

1818年 嘉庆二十三年，嘉庆皇帝东巡盛京至法轮寺拜谒并留下御制诗文。

1829年 道光九年，从礼部侍郎凯音布之请，重新整修法轮寺。并东巡盛京至法轮寺拜谒并留下御制诗文。

1900年 庚子之乱。

1905年 日俄战争爆发，北塔法轮寺受到战火摧毁，寺内所珍藏的上百部经卷和佛龛、法器遭到严重毁坏。大殿隔扇及供桌、大经柜及柜内108部经文全部被焚毁。

1921年 随着北塔法轮寺日趋残破，寺院成为沈阳市民自发停放棺椁的场所。寄放贫民百姓的棺椁，这种情况一直持续到解放前。

1937年 伪满康德四年，重新修缮。

1949年 新中国成立，后由沈阳市民政部门将北塔法轮寺内的寄骨进行火化，它也恢复了以往的一些宗教功能。但那时的北塔法轮寺已残破不堪。

1959年 北塔法轮寺归沈阳市民政局管辖，不久便将残存的钟、鼓楼拆去，

1962年 1月被沈阳市人民委员会公布为市级文物保护单位。此后十年动乱期间，大殿内的佛像被推倒，再次恢复寄存骨灰的职能。

1984年 时任市长李长春号召文物大开发，国家拨款对北塔进行维修，并在原址进行了修复，并重塑了部分佛像。

1987年 10月正式对外开放。

2002年 7月经辽宁省宗教事务局批准，法轮寺正式恢复为宗教活动场所；并礼请四川省甘孜州理塘县理塘长青春科尔寺第九十三代住持——第四世夏坝活佛出任住持，还将藏地很多殊胜的法事、法宝带到北塔，使北塔法轮寺重新恢复了生机，风采更胜往昔。