直属站：沈阳站，沈阳北站，苏家屯站，裕国站，大连站，大连北站，金州站，锦州站，山海关站，丹东站，通辽站，长春站，长春北站，四平站。

国境站：丹东站，图们站，集安站。

车务段：霍林郭勒运营维修段、阜新车务段、长春车务段、通化车务段、梅河口车务段、延吉车务段、吉林车务段、赤峰车务段、通辽车务段、锦州车务段、大连车务段、本溪车务段、鞍山车务段、沈阳车务段、白城车务段。

客运段：沈阳客运段、大连客运段、长春客运段。

机务段：沈阳机务段、大连机务段、吉林机务段、通辽机务段、锦州机务段、苏家屯机务段、梅河口机务段、白城机务段。

供电段：沈阳供电段、大连供电段、长春供电段、吉林供电段、通辽供电段、锦州供电段、白城供电段。

工务段：长春高铁基础设施段、沈阳高铁基础设施段、阜新工务段、四平工务段、长春工务段、延吉工务段、通化工务段、沈阳工务机械段、山海关工务段、鞍山工务段、吉林工务段、丹东工务段、大连工务段、白城工务段、锦州工务段、通辽工务段、沈阳工务段、赤峰工务段。

车辆段：沈阳客车厂、长春车辆段、沈阳车辆段、苏家屯车辆段、锦州车辆段、吉林车辆段、通辽车辆段。

电务段：沈阳电务段、大连电务段、长春电务段、吉林电务段、通辽电务段、锦州电务段。

动车段：沈阳动车段。

运输辅助单位：长春房产段、通辽房产段、沈阳房产段、吉林房产段、锦州房产段，

非运输企业：长春春铁物流集团有限公司、辽宁铁信实业集团有限公司、大连铁越集团有限公司、沈阳铁源集团有限公司、通辽铁盛商贸（集团）有限公司、沈阳铁道物流集团有限公司、沈阳铁道石油化工集团有限公司、沈阳铁道工业集团有限公司、沈阳铁道文化旅游集团有限公司、沈阳铁道工程建筑集团有限公司、北京沈铁奉发科技集团有限公司、沈阳铁路建设监理有限公司、辽宁港铁国际物流实业集团有限公司、沈阳铁道工程建设管理有限公司、沈阳轨道车辆有限公司、沈阳铁道科学技术研究所有限公司