根据上述职责，遂宁市发展和改革委员会内设19个机构和市重点工程建设办公室：

（一）办公室（二）政策法规科（三）发展规划科

（四）国民经济综合科（市国民经济和装备动员办公室）

（五）经济体制综合改革科（六）固定资产投资科（行政许可科）（七）农村经济科

（八）能源交通运输科（九）产业发展科（十）社会发展科（十一）财政金融科

（十二）项目管理协调科（十三）价格管理科（十四）收费管理科（十五）人事科（党委办公室）（十六）财务科（铁路建设资金管理科）（十七）重大项目稽察特派员办公室

（十八）价格监督检查分局（价格举报中心）市重点工程建设办公室