2003年抗击“非典”工作表现突出，“非典”现场调查组被梧州市人民政府授予“防非先进集体”，黄贵彪等5名同志获梧州市“防非先进个人”。2004年12月通过自治区技术监督局计量认证复审、自治区卫生厅职业卫生技术服务资质评审和自治区疾控中心hiv筛查实验室的审查，2006年艾滋病防治先进单位，2007年艾滋病确证实验室通过国家参比实验室专家评审。

2020年，获“2020年广西健康文化宣传服务月健康传播文化作品征集互动优秀组织奖”。

2021年，中心获得“梧州市创建国家卫生城市先进集体”，“自治区艾滋病攻坚工程(2015-2020年)突出成绩集体”。

2022年4月，荣获2022年广西五一劳动奖状。