盟林草局“三定”规定核定内设机构10个:办公室、治沙造林科、森林资源管理科、草原监督管理科、自然保护地湿地和野生动植物保护管理科、国有林场和种苗管理科、改革发展和科技科、计划财务科、森林草原防火科、机关党委（人事科）。

办公室：负责机关日常运转，承担宣传、意识形态、文秘、保密、档案、会议、督查、普法、信访、信息、精神文明建设和政务公开等工作。

治沙造林科：拟订国土绿化和防沙治沙政策，拟订防沙治沙、沙化土地封禁保护区建设规划、并监督实施。组织开展荒漠调查、动态监测与评价相关工作。综合管理林业重点生态保护修复工程，指导植树造林、封山（沙）育林和以植树种草等生物措施防治水土流失工作。负责碳汇造林项目的组织实施与管理，林业碳汇交易平台建设及对碳汇交易实施监督管理。组织实施荒漠化防治重点生态工程。组织指导沙尘暴灾害预测预报和应急处置。承担防治荒漠化公约履约工作。指导基层林业站的建设和管理。承担古树名木保护、林业和草原应对气候变化相关工作。承担全盟绿化委员会日常工作。

森林资源管理科：拟订森林资源保护发展的政策措施，组织编制并监督执行森林采伐限额。组织开展森林资源动态监测与评价相关工作。监督管理森林资源。承担林地相关管理工作。组织编制林地保护利用规划并监督实施。指导编制森林经营规划和森林经营方案并监督实施。指导监督林木凭证采伐、运输。指导林业有害生物防治、检疫和预测预报工作。指导森林行政执法工作。

草原监督管理科：拟订草原生态保护修复与合理利用的政策规划并组织实施。参与编制防沙治沙规划。指导草原生态保护工作，组织实施草原生态补偿工作。负责禁牧和草畜平衡工作，指导草原休牧、轮牧工作，组织开展基本草原划定和保护工作。负责指导草原生态修复治理工作，组织实施草原生态保护修复工程。指导草原鼠虫病等有害生物灾害防治和预测预警。组织开展草原资源动态监测与评价相关工作。指导基层草原站的建设和管理。拟订草原生态保护监督相关政策措施并组织实施。负责草原行政执法监督工作，协调处置破坏草原重大案件。监督管理草原的开发利用，组织开展草原功能区划定工作。监督管理草原旅游相关工作。

自然保护地湿地和野生动植物保护管理科：拟订湿地资源保护政策措施，组织开展湿地和陆生野生动植物资源调查、动态监测与评价相关工作。组织开展野生动物救护、栖息地恢复发展、疫源疫病监测与防控工作。监督管理国家公园等各类自然保护地，起草各类自然保护地保护发展规划，提出新建、调整各类国家级和自治区级自然保护地的审核建议。组织实施各类自然保护地生态修复工作。指导湿地保护工作，组织实施湿地生态修复、生态补偿工作，监督管理重要湿地和湿地公园，监督管理湿地的开发利用，承担国际湿地公约履约相关工作。监督管理陆生野生动植物捕猎或采集、驯养繁殖或培植、经营利用工作。研究提出国家和自治区重点保护的陆生野生动物、植物名录调整意见。按分工监督管理陆生野生动植物进出口工作。承担世界自然遗产项目和世界自然与文化双重遗产项目相关工作。监督管理自然保护地旅游开发。

国有林场和种苗管理科：指导国有林场苗圃建设和发展。承担林木种子、草种管理工作，组织种质资源普查、收集、评价、利用和种质资源库建设。组织良种选育、审定、示范、推广，负责林木种子、草种监督检验工作。指导良种基地、保障性苗圃建设。监督管理林木种苗、草种质量和生产经营行为。指导天保工程区管理工作，指导公益林区划和公益林建设。拟定全盟蚕业发展规划，负责全盟蚕业管理工作。

改革发展和科技科：组织指导集体林权制度和重点国有林区、国有林场、草原等改革的相关工作。组织拟订农村牧区林业和草原发展的政策措施并指导实施。指导农村牧区林地、林木和草原承包经营、流转管理。组织开展林业和草原科学研究、成果转化和技术推广工作。承担林业和草原科技标准化、质量检验、监测和知识产权等相关工作。监督管理林业和草原生物种质资源、转基因生物安全。拟订林业和草原产业化发展规划和产业政策并监督实施，负责林业和草原资源综合开发利用的行业管理。承担行政复议、行政应诉等工作。

计划财务科：拟订林业和草原发展战略、规划并监督实施。监督管理林业和草原资金及重点生态工程和项目实施。编制下达年度生产计划。参与组织生态扶贫和相关生态补偿制度的实施。组织申报并指导涉外、援外项目实施，开展林业和草原对外合作与交流。负责部门预算、统计信息、审计稽查、机关财务核算管理和所属单位计划财务监督管理工作。

森林草原防火科：负责落实全盟综合防灾减灾规划相关要求，组织编制森林和草原火灾防治规划并指导实施，指导开展防火巡护、火源管理、防火设施建设等工作。组织指导开展森林和草原防火宣传教育、监测预警、督促检查等工作。指导林业草原安全生产。

机关党委（人事科）：机关党委（人事科）。负责机关和所属单位的党群、纪检和干部人事、机构编制、劳动工资、教育培训工作。指导本行业人才队伍建设。