截至2024年，医院已开设47个临床医技科室。医院面向国内外延揽高层次医疗技术专业人才，已吸引来自国内外知名医院的五十余名包括院士、长江学者特聘教授、新世纪百千万人才工程国家级人选、国家特支计划人才、福建省引进高层次人才、厦门市杰出人才、厦门市双百人才、厦门市高层次卫生人才在内的学科带头人和学术骨干。

医院重点规划肿瘤诊治中心、脏器移植中心、医学诊断中心、急重症医学中心、老年疾病中心、神经疾病中心和微创诊疗技术中心，形成以诊治疑、难、重、杂症为特色的临床医疗体系。

厦大翔安医院是厦门市唯一一家拥有人体肝脏移植、肾脏移植执业资质的医院，同时也是唯一一家常态化开展航空紧急医学救援的医院。2020年医院取得肝、肾移植手术例数和航空医疗救援例数均位居福建省第一的亮眼成绩，未来前景可期。