1·市委农办秘书科

2·办公室

3·综合科

4·法规科（审批服务科）

5·政策与改革科（农村合作经济指导科）

6·发展规划科（建设国家现代农业示范区办公室）

7·计划财务科

8·乡村产业发展科

9·农村社会事业促进科

10·市场与信息化科（对外交流与合作科）

11·科技教育科（市农业转基因生物安全管理办公室）

12·农业资源保护与利用科

13·农产品质量安全监管科

14·种植业管理科（农药管理科）

15·兽医科

16·畜牧科

17·渔业渔政管理科

18·种业管理科

19·农业机械化管理科

20·农田建设科

21·人事科

22·机关党委

23·离退休人员管理服务科