区市场监督管理局内设14个职能科室：

（一）办公室

（二）组织人事科

（三）政策法规科

（四）行政许可科（企业注册科）

（五）食品安全综合协调和督查科(应急管理与宣传科)

（六）消费者权益保护科（12315举报申诉指挥中心）

（七）个体私营经济监督管理科（企业监管科、企业信用办）

（八）市场规范管理科

（九）网络经营监督管理科（信息化办公室）

（十）食品生产与流通监督管理科（保健品化妆品监督管理科）

（十一）餐饮服务监督管理科

（十二）药品医疗器械监督管理科

（十三）质量标准和计量监督管理科

（十四）特种设备安全监察科