（一）办公室。负责机关和下属单位的机构编制、干部人事管理工作；组织指导机关和下属单位的党建、宣传、精神文明建设、卫生健康工作；督办局党委决定、决议的执行情况；负责离退休干部的管理工作。负责文电、会务、机要、档案、后勤等机关日常运转工作；承担信息、保密、政法（综治）、维稳、信访、政务公开等工作。负责人大政协建议提案的督办工作。督办局行政决定工作部署的执行情况。负责交通运输系统民兵预备工作；承担交通战备工作。组织制定交通战备建设规划，对全区交通建设规划和交通通信设施建设提出国防要求，编制战时保障方案；贯彻执行国家有关财务等方面的法规及方针、政策，制定相应的规则制度，并组织实施；负责局机关及指导所属单位财务管理、内部审计和国有资产的管理工作；负责全局节能减排工作。

（二）政务服务股。负责受理和办理本部门所有行政审批和公共服务事项，负责行政许可、政务服务组织实施工作；负责驻区行政服务中心窗口建设和管理及相关服务咨询等日常工作；推进行政许可、政务服务标准化建设，做好行政许可、政务服务便民化改革工作。

承办相关行政复议、行政诉讼工作；承担机关有关规范性文件的合法性审核工作，指导、监督全区交通运输保护综合执法工作。负责以局名义进行的行政处罚案审工作。指导交通行业体制改革工作。负责普法、诚信交通建设。

（三）安全监督股（应急办）。组织公路、水路安全生产政策、制度、标准和应急预案并监督实施。综合指导和监督交通运输行业安全生产、应急管理、公路水路联防、交通安全、消防安全、维稳安保、环境保护、反恐防爆等工作。依法组织或参与有关事故的调查处理工作。

（四）综合股。负责国家和省市有关道路运输方针、政策、法规及指令的贯彻实施；制定本地区行业发展规划和道路运输有关规章的实施细则，建立有关的管理制度，合理安排运力、站点布局；根据《中华人民共和国道路运输条例》相关规定，负责对辖区内道路运输行业（普货运输、旅客运输、机动车维修、机动车驾驶员培训、出租客运、公交客运、道路运输站场建设）准入、许可、发证等工作进行监督管理。负责运输管理方面生态环境保护、食品安全、防汛抗旱和春运等工作。

负责贯彻执行党和国家有关公路交通管理工作的方针、政策、法律、法规，拟定本区公路行业的发展战略、方针政策和规章制度并监督执行；组织制定公路建设、公路养护管理方面政策和规章制度，并监督执行；负责普通公路建设、公路养护工作的行政管理；维护路产路权和超限超载车辆治理工作，保障工程建设、养护实施的正常程序。

贯彻执行国家有关水路运输、港口、渡口管理的方针政策和法律法规；负责全区水路运输行业管理、地方海事、渔船检验和监督管理职责，组织实施港政、航政船舶检验相关政策制度和技术标准。负责港口建设工作，依据《港口法》实施港口行政管理；协调和组织实施抢险、救灾、战略物资等紧急水路运输任务、政府指导性计划运输等任务；负责民间渡口管理及其安全生产以及码头建设。

（五）规划建设管理股。负责全区交通计划、统计工作；制定全区交通行业的发展规划、中长期计划，负责综合协调、指导全区交通运输行业管理及交通基础设施的建设等有关事项的工作，并对此进行监督管理；负责交通运输系统改制企业遗留问题工作；负责交通运输科技、教育培训工作。协调综合交通重大项目建设，组织开展权限内普通公路项目初步设计审核、施工图审批和建设阶段督导工作，指导监督交工验收，组织竣工验收。负责权限内交通建设招投标、资质、信用管理。