2019年11月，云南省教育厅基础教育处获得“全国维护妇女儿童权益先进集体”荣誉称号。

云南省教育厅荣获2011-2015年全国法治宣传教育先进单位表彰。省教育厅政策法规处副处长龙德芳、禄劝县民族小学教师杨文华（女）等26人荣获2011-2015年全省法治宣传教育先进个人表彰。

2021年4月，云南省教育厅学校保卫后勤处荣获全国食品安全工作先进集体。

2021年4月，云南省教育厅发展规划处被授予“云南省脱贫攻坚先进集体”称号。

2021年6月15日，云南省教育厅教育督导室党支部被中共云南省委省直机关工委表彰为先进基层党组织。

2021年11月17日，全国普法办公室拟表彰云南省教育厅政策法规处为2016-2020年全国普法工作先进单位。

2021年11月，云南省教育厅基础教育二处被中国科协授予“全民科学素质工作先进集体”称号。