1926年10月，学校前身私立扬州中学创建。

1928年，开始举办高中。

1950年，定名为扬州市私立新华中学。

期间，先后融入私立竞进中学、私立邗江中学、平民中学、春晖中学、同仁中学（祝同中学）、集美中学、以及双桥一中和西苑中学等学校。

1956年，更名为扬州市新华中学。

1999年，被确认为江苏省重点中学。

2003年，成为江苏省三星级普通高级中学。

2006年7月，成为江苏省四星级普通高级中学。

2012年，通过江苏省四星级普通高中复评。