直属单位共有14个。其中行政单位4个，事业单位10个。行政单位分别是：1、五村镇人大办，2、五村镇党委办，3、五村镇团体，4、五村镇人民政府机关本级；事业单位分别是：1、百色市田阳区五村镇财政所，2、五村镇卫生健康服务所，3、五村镇文化体育广电和旅游工作站，4、五村镇社会保障服务中心，5、五村镇乡村建设综合服务中心，6、五村镇农业综合服务中心，7、五村镇社会治安综合治理中心，8、五村镇村干部，9、五村镇乡村振兴服务中心，10、五村镇退役军人服务站。

五村镇党政机关内设机构设置为：党政办公室、党建工作办公室、政法工作办公室、经济发展和改革办公室、社会事务办公室。