根据上述职责，市环境保护局周村分局设3个内设机构。

一 办公室

组织协调局机关日常工作；负责局机关文电、会务、督办、档案、机要、保密、政务公开等工作；负责机关后勤服务和行政事务工作；负责局机关和下属单位的组织、人事、机构编制等工作；负责机关离退休干部管理服务工作；承办各类表彰奖励工作。

二 财务科

承担劳动工资和社会保障等工作；负责局机关财务及国有资产管理工作；负责全局财务检查、审计工作；协调环境保护利用外资项目工作。

三 综合业务科

负责建设项目环境影响评价报告书（表）、登记表的审核、审批工作，建设项目“三同时”（同时设计、同时施工、同时投产）验收工作；指导清洁生产；组织环保行政处罚、行政复议和行政应诉等工作；负责处理区人大政协有关环境议案、提案；指导全区环保普法工作；组织实施环境目标责任制、污染源限期治理和达标排放；具体承办区环境保护委员会办公室的日常工作；协调环保模范城市创建工作；组织拟订生物多样性保护计划；组织编制并指导实施全区自然生态保护规划；负责农村生态环境保护。