研究院的运行模式是在校长领导下的院长负责制，在学术委员会指导下，实行pi聘任制，以单个实验室为基本单位进行组建，研究院的所有师生将为世界的生命科学努力奋斗，秉承的使命与理念是：

（1）全面致力于生命科学前沿领域的基础研究，开展与生命科学相关的应用基础研究和转化医学的研究，对于国家的整体经济建设，在长三角形成领军技术产业发展的战略优势，打造具有核心竞争力的高科技基地；

（2）结合浙江大学现有的优势学科后，凝练形成一个新的增长点，通过生命科学基础理论的研究、解析疾病发生发展的分子机理，并据此进行疾病干预和新药研发，为人类健康服务，全面提升浙江大学生命科学的研究水平，带动相关领域其他学科的发展，建成国际一流的研究机构；

（3）生研院要形成开放的、现代化的、国际化的创新型平台，创建国内一流、世界知名的生命科学研究基地。并为国家培养一批在生命科学领域高水平的创新型生物医学优秀青年科学家做出突出贡献；

生研院的研究方向是开放的，包括肿瘤生物学、细胞生物学、系统和发育生物学、结构生物学、生物化学及与肿瘤、人类主要疾病相关的学科，致力于揭示生命现象的基本规律及其与人类、健康和疾病之间关联性和规律性的原创型研究，加强学科交叉和成果转化，积极推进医疗、生物等产业发展。