清光绪十六年（1890年），学校前身绥丰书院成立。

光绪三十二年（1906年），绥丰书院改为钦州中学堂，校址在城北镇龙岗上。

光绪三十三年（1907年）， 因粤督派新军统领郭人漳镇压那丽、那彭、那思民众反糖捐斗争的影响，中学堂一度停课。

光绪三十四年（1908年）春，钦廉道龚心湛用中学堂校址开设警察学务讲习所。

宣统二年（1910年），中学堂复课，改校名为钦州中学，并增设简易师范班。

宣统三年，辛亥革命期间，地方政权未建立，中学停课。

民国3年（1914年）秋，中学恢复上课，并易名广东省立钦州中学校。

民国19年，学校改为广东省立第十二中学校。

民国20年，省立第十二中学增设高中师范（中师）班。

民国21年，只招收中师生，不招收高、初中普通班学生。

民国24年，奉命将广东省立第十二中学校改为广东省立钦州师范。

原省立十二中改制为省师后，地方政府认为“毋须多办师范”，遂将原县立简易乡村师范改为县立中学，校址在文昌阁，后迁农校上课。

民国26年， 驻镇龙楼军队撤离，县立中学迁回镇龙楼。

民国30年，县立中学改为县立第一中学。

解放后， 先后改名为钦县第一中学、钦州县第一中学。

1984年起，更名钦州市第一中学。

2007年，学校高中新校区开始兴建。

2008年8月，学校高中部建成使用。

2013年12月，学校通过自治区示范性普通高中复查评估。