牡丹区实验小学校歌《迎着清晨灿烂的阳光》由现任校长王振中作词，菏泽学院刘渝东教授作曲，本校小白鸽合唱团演唱，朱呈呈、孙靖、周佳馨、贾萌、赵天宇、王秋珂首唱。

迎着清晨灿烂的阳光，沐浴着牡丹沁人的芬芳。我们的学校像花园一样，彩蝶飞舞、花儿绽放，花儿绽放！

爱国爱民，信守不渝；敬爱的老师为我们指引奋斗的方向！自强不息，厚德载物；亲爱的老师用双手托起明天的太阳！啊，美丽的牡丹区实小，给了我童年的欢乐；啊，美丽的牡丹区实小，放飞我簇新的理想……

（首句同第一段）……歌声阵阵、书声琅琅，书声琅琅！博学善思，求实创新；敬爱的老师为我们打开知识的天窗！团结文明，和谐奋进；亲爱的老师为我们插上智慧的翅膀！啊，美丽的牡丹区实小，在这里我们勤奋学习！啊，美丽的牡丹区实小，在这里我们百炼成钢！