2020年8月，该院设立以下部门：

办公室：负责文电、会务、档案管理及财务工作，主任邬莉萍；

政治部：主管队伍建设、意识形态及宣传工作，主任陈明；

第一检察部（含生态环境保护及未成年人检察职能）：承担刑事案件审查逮捕、起诉及生态保护案件办理，主任邓平；

第二检察部：负责民事行政诉讼监督及公益诉讼，主任陈丽；

第三检察部（含司法警察职能）：监督刑罚执行及强制医疗，主任杜欢欣。