设有6个内设股室：

办公室（统筹机关事务）

财务股（资金预算管理）

监测应急股（环境监测与应急）

水与生态股（水污染防治）

大气与环境管理股（大气污染治理）

法制督查股（执法监督）

下设两个事业单位：

岐山县生态环境保护综合执法大队（副科级，含3个片区中队）

岐山县环境监测站（副科级，负责环境质量监测）